A Direção tem como principal missão os assuntos de administração geral e comunicação institucional. Preocupa-se com a organização e supervisão de todos os projetos e iniciativas e é da sua responsabilidade a elaboração e acompanhamento do Plano Pastoral e respetivo Relatório de Atividades.
A Direção tem como visão estratégica específica a promoção da Doutrina Social da Igreja no meio universitário e do ensino superior e uma maior expressão do Grupo de Colaboradores do IUJP na Missão Pastoral do Instituto.